Stredná Amerika sa po rozpade španielkych kolónii, chcela unifikovať a pokračovať ako moderný federálny štát. Bohužiaľ sa nová krajina musela hneď od zaćiatku potýkať s mnohými problémami a nestabilitou. Táto situácia bola do veľkej miery umelo vyprovokovaná silami, ktoré mali benefity z koloniálneho zaostalého sociálno ekonomického systému, ktorého sa nemienili bez boja vzdať.
Z tohto dôvodu dochádza ako po celej amerike ku konfliktu, kde stoja na jednej strane konzervatívne sily, podporované katolíckou cirkvou a na druhej osvietenecký liberáli. Konflikt sa postupne presúva z úrovne ideovej do ozbrojeného boja, ktorý trvá z rôznou intenzitou dlhýčas a postupne zachvacuje rôznym spôsobom celú strednú ameriku. V Guatemalskej histórii stoja proti sebe dve veľké postavy, ktoré ovplyvňujú dianie v celej oblasti a to konzervatívny R. Carrera a liberál gen. F. Morazán.
Po bojoch si postupne v Guatemale upevňujú postavenie konzervatívne sily, aby ustanovili svoj režim, ktorý krajinu znovu vracia späť k zaostalému koloniálnemu spoloćenkému a sociálnemu systému. Tento režim trvá až do roku 1871, kedy znovu prevratom liberáli získavajú moc.